由臺南市政府社會局委託美善基金會辦理「心智障礙者日間服務中心」，中心服務對象為18至65歲領有中度身心障礙證明之自閉症、智能障礙及多重障礙者，提供心智障礙者生活技能，給予適當的工具訓練及日常生活支持，提升生活自理與工作能力。
中心提供日間托育服務，制定並執行個別化服務計畫，根據每人不同需求，提供多元服務，包含生活自理、健康維護及休閒娛樂等服務，並定期家庭訪問，加強與個案家庭之間的連結。加上透過治療師的律動課程，每次提供4-8位的服務使用者肢體大動作與精細動作的課程活動，正確坐姿評估、使用助行器行走，藉由團體課程，讓服務對象獲得肢體動作與社交互動上的能力，延緩日常生活的退化。
現接受心智障礙者日間服務中心服務的小君〈化名〉，是一位智能障礙極重度的服務使用者，於101年初開始接受服務，原本小君的家長委由保母日間托育，在得知美善基金會有承攬日間服務中心後，順利申請進入。小君媽媽表示：「小君最大的進步就是會協助垃圾分類、擦桌子及洗碗等日常家事，生活自理能力有明顯的提升，心智障礙者日照中心不僅有托育功能，同時透過多元的活動設計，也可有助穩定服務使用者的情緒，而積極社區參與的活動，讓小君變得更活潑也樂於分享在中心的學習。」
中心主動與社區內各項資源連結，針對社區居民加強宣導以及敦睦服務，不僅讓身心障礙者增加社會參與的機會，包含在社區內演出耶穌誕生的故事，讓社區居民更了解及接納身心障礙者，透過在公園、活動中心或賣場等場所，利用社區資源提供符合自然支持系統的社會融合服務。
社會局局長曹愛蘭表示透過各項活動規劃，如繪畫、律動、陶藝活動、代工技能訓練及社會參與，發展出他們的潛能，期許服務對象在適合年齡的環境中並獲得支持服務，提供綿密的社會支持網路，搭配各項福利服務，培養個案在社區中獨立生活之能力，也能讓服務對象家長有喘息的空間。未來，社會局將運用公益彩劵盈餘進行空間修繕部分，增加無障礙廁所、設計居家生活空間以及改善律動空間，讓服務使用者有更貼近家的感覺，同時可在更舒適中環境學習，以提升服務品質。